2006年5月，东南大学和常州市人民政府签署校地全面合作协议， 双方合作共建东南大学常州研究院。2007年12月28日由东南大学校长易红和常州市委书记范燕青为研究院成立举行揭牌。 2008年4月6日诺贝尔奖获得者丁肇中教授受聘担任研究院名誉院长。

东南大学常州研究院设在常州科教城内，一期3400平方米实验室已投入使用， 研究院将充分利用东南大学科技资源，建立科技项目合作平台，探索官产学研合作的新体制， 努力发展成为人才培养、科技创新、成果转化、产业并举的创业基地，为常州地区的经济发展、社会进步服务。